Bilim ve endüstri arasındaki işbirliğinden, yerel faydalı toprak bakterilerini kullanarak mahsul hastalıklarıyla mücadelede yenilikçi bir yöntem ortaya çıkmıştır.
John Innes Center'dan (İngiltere) bir bilim adamları ekibi, çiftlik alanlarından toplanan topraktan yüzlerce Pseudomonas bakterisi suşunu izole etti ve test etti ve ardından 69 tanesinin genomunu sıraladı.
Ekip, patojen aktivitesini engelleyen suşların genomlarını, yapmayanlarla karşılaştırarak, patates mahsullerini zararlı bakterilerden korumak için anahtar bir mekanizma belirleyebildi.
Daha sonra, kimya ve genetiğin bir kombinasyonunu ve bir dizi deneyi kullanarak, bilim adamları, siklik lipopeptitler adı verilen küçük moleküllerin üretiminin, patates kabuğunun (patates mahsulünde önemli hasara neden olan bakteriyel bir hastalık) kontrolünde önemli olduğunu gösterdiler. Bu küçük moleküller, patojenik kabuklara neden olan bakteriler üzerinde antibakteriyel etkiye sahiptir ve faydalı Pseudomonas bakterilerinin bitki köklerini göç etmesine ve kolonize etmesine yardımcı olur.
Deneyler ayrıca, sulamanın topraktaki genetik olarak çeşitli Pseudomonas popülasyonunda önemli değişikliklere neden olduğunu göstermiştir.
eLife'da yayınlanan çalışma, bilim adamlarının bir tarlanın hemen hemen her alanının mikrobiyomunu inceleyebilecekleri ve farklı toprak, zirai kimyasal ve çevresel koşulları hesaba katabilecekleri bir yöntem sunuyor.
Bilim adamları, yüksek hızlı genetik dizilemedeki ilerlemeleri kullanarak, yararlı bakteriler için toprak mikrobiyomunu test edebilir ve patojenleri bastırmak için hangi moleküllerin üretildiğini belirleyebilir. Bir sonraki adım, faydalı mikroorganizmaları çoğaltıp aynı alana geri vermektir.
Mikrobiyom artırıcılar için potansiyel uygulamalar, yumru köklerin yüzeyine sprey olarak veya damla sulama kullanılarak doğrudan toprağa bakteri kokteylleri uygulanmasını içerir.